Лечение инфекционных процессов слизистой полости рта и пародонта может осуществляться в виде местной антибактериальной терапии, если это процессы оппортунистического характера и они не распространяются за пределы входных ворог инфекции. При заболеваниях с хроническим течением (например, при хроническом генерализованном пародонтите, кандидозе, актиномикозе челюстно-лицевой области, герпес-вирусной инфекции) необходимо следить за состоянием иммунной системы (иммунограмма, показатели фагоцитоза и уровня иммуноглобулинов).
Следует учитывать возможность грибкового происхождения заболевания (кандида-ассоциированный пародонтит и др.); Возможна последовательная замена (или доминирование в микробной ассоциации) одних видов другими в процессе антибактериальной терапии, что может наблюдаться, в частности, при пародонтите и одонтогенной инфекции. Отдельные виды патологии челюстно-лицевой области имеют свои особенности при выборе тактики антибиотикотерапии.